Thầy giảng Phêrô Nguyễn Khắc Tự sinh năm 1808 tại Ninh Bình. Thầy dâng mình phục vụ trong Giáo phận Tây Đàng Ngoài. Năm 20 tuổi, thầy về phụ giúp thừa sai Pierre Dumoulin Borie Cao, còn gọi là Đức cha Cao.

Khi Đức cha Cao bị bắt, thầy Tự đã xin được đi theo dù biết trước những khổ hình đang chờ đợi. Trước sự lo ngại của Đức cha, thầy bày tỏ lòng trung thành và tin tưởng vào ơn Chúa trợ giúp.

Thầy Tự cùng bị bắt với Đức cha tại Bố Chính rồi bị giải về Đồng Hới. Tại công đường, vì kiên quyết không chối đạo và từ chối đạp lên Thánh Giá, thầy bị đánh đòn. Dù bị đe dọa, mua chuộc, thầy vẫn khẳng khái trả lời: “Bẩm quan lớn, tôi thà chết còn hơn chối đạo”. Thầy tiếp tục bị tra tấn dã man, bị phơi nắng và thậm chí bị ném vào hầm rắn độc nhưng vẫn bình an vô sự.

Trong tù, niềm an ủi lớn của thầy là được giam chung với Đức cha Cao. Tấm gương của vị giám mục đã nâng đỡ đức tin cho thầy. Thầy còn được linh mục Ngân giải tội và cho rước lễ.

Ngày 10 tháng 7 năm 1840 dưới triều vua Minh Mạng, thầy Phêrô Nguyễn Khắc Tự đã bị xử trảm tại pháp trường Đồng Hới khi mới 32 tuổi.

Thầy giảng Phêrô Nguyễn Khắc Tự được tôn phong chân phước ngày 27 tháng 5 năm 1900 và được nâng lên hàng hiển thánh ngày 19 tháng 6 năm 1988.